Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR1D2Q14995 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D2Q14995 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D2Q14995 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D2Q14995 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D2Q14995 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D2Q14995 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D2Q14995 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D2Q14995 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D2Q14995 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D2Q14995 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D2Q14995 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D2Q14995 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D2Q14995 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D2Q14995 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms