Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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