Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
GRIN2AQ12879 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
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