Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NFIAQ12857 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFIAQ12857 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
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