Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 RPC34YNR003C 954 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YBR012CYBR012C 420 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 GLO3YER122C 1482 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 IBA57YJR122W 1494 nt5.49□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF3Q07807 ASF2YDL197C 1578 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YGL176CYGL176C 1665 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 HXT5YHR096C 1779 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 MKS1YNL076W 1755 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 ATG1YGL180W 2694 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 VMA13YPR036W 1437 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 NOP58YOR310C 1536 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 PCL8YPL219W 1479 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 WBP1YEL002C 1293 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 RPL12AYEL054C 498 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 TDH3YGR192C 999 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YHR127WYHR127W 732 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YIL028WYIL028W 399 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 IGO1YNL157W 507 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 ACS2YLR153C 2052 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 EAR1YMR171C 1653 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 RSM10YDR041W 612 nt5.47□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF3Q07807 UTR4YEL038W 684 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 SLO1YER180C-A 258 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YPT32YGL210W 669 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 TIM10YHR005C-A 282 nt5.47□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF3Q07807 YKL107WYKL107W 930 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 UTP23YOR004W 765 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YOR225WYOR225W 330 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 DCC1YCL016C 1143 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 PWP1YLR196W 1731 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 FAR10YLR238W 1437 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 SYG1YIL047C 2709 nt5.46□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 ATG20YDL113C 1923 nt5.46□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 MAL11YGR289C 1851 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 ARP2YDL029W 1176 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 ERD1YDR414C 1089 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 PRO3YER023W 861 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 PHO86YJL117W 936 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 YMR099CYMR099C 894 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 WRS1YOL097C 1299 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 MFM1YPL060W 1242 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 ATE1YGL017W 1512 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 DAK1YML070W 1755 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 TRM82YDR165W 1335 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 NGL2YMR285C 1548 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 KEI1YDR367W 666 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 DIG2YDR480W 972 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 AGA2YGL032C 264 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 RPT6YGL048C 1218 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 PCL7YIL050W 858 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 GPX1YKL026C 504 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 LEE1YPL054W 906 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 IME4YGL192W 1803 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 BUD8YLR353W 1812 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 GCD1YOR260W 1737 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 COT1YOR316C 1320 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 SOG2YOR353C 2376 nt5.44□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 YAR047CYAR047C 321 nt5.44□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 NTH2YBR001C 2343 nt5.44□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 GRE1YPL223C 507 nt5.44□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 SHE3YBR130C 1278 nt5.44□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 MPP10YJR002W 1782 nt5.44□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 MET17YLR303W 1335 nt5.44□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 YAP1YML007W 1953 nt5.44□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 NRD1YNL251C 1728 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 AVT3YKL146W 2079 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 TUL1YKL034W 2277 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 VAB2YEL005C 849 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 PRP18YGR006W 756 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 SNL1YIL016W 480 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 RNR2YJL026W 1200 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 CAP1YKL007W 807 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 SYM1YLR251W 594 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 YLR252WYLR252W 306 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 NIS1YNL078W 1224 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 YOL029CYOL029C 606 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 AIM39YOL053W 1188 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 RIB4YOL143C 510 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 CYC2YOR037W 1101 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 GAL10YBR019C 2100 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 ETR1YBR026C 1143 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 MRPL27YBR282W 441 nt5.43□□□□□ -1.54 RIP-Chip
PUF3Q07807 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 HES1YOR237W 1305 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt5.43□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 SSY5YJL156C 2100 nt5.42□□□□□ -1.54 RIP-Chip
PUF3Q07807 RPN4YDL020C 1596 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 IXR1YKL032C 1794 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 MSW1YDR268W 1140 nt5.42□□□□□ -1.54 RIP-Chip
PUF3Q07807 YDR271CYDR271C 372 nt5.42□□□□□ -1.54 RIP-Chip
PUF3Q07807 YDR445CYDR445C 408 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 MAM1YER106W 909 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 YGR160WYGR160W 612 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 GTR2YGR163W 1026 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 SYN8YAL014C 768 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 PRP45YAL032C 1140 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 SEC22YLR268W 645 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.1 ms