Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms