Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.7 ms