Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN2BP42772 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2BP42772 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2BP42772 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2BP42772 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2BP42772 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2BP42772 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2BP42772 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2BP42772 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2BP42772 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2BP42772 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2BP42772 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms