Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC5P28715 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms