Protein–RNA interactions for Protein: O60462

NRP2, Neuropilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRP2O60462 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRP2O60462 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRP2O60462 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRP2O60462 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRP2O60462 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRP2O60462 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRP2O60462 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRP2O60462 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRP2O60462 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRP2O60462 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRP2O60462 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRP2O60462 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRP2O60462 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRP2O60462 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRP2O60462 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRP2O60462 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRP2O60462 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRP2O60462 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRP2O60462 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRP2O60462 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRP2O60462 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRP2O60462 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRP2O60462 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRP2O60462 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRP2O60462 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRP2O60462 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NRP2O60462 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NRP2O60462 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NRP2O60462 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NRP2O60462 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRP2O60462 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRP2O60462 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRP2O60462 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRP2O60462 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NRP2O60462 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRP2O60462 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRP2O60462 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRP2O60462 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRP2O60462 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRP2O60462 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRP2O60462 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRP2O60462 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRP2O60462 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRP2O60462 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRP2O60462 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRP2O60462 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NRP2O60462 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRP2O60462 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRP2O60462 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRP2O60462 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRP2O60462 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRP2O60462 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRP2O60462 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRP2O60462 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRP2O60462 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NRP2O60462 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NRP2O60462 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRP2O60462 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRP2O60462 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NRP2O60462 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRP2O60462 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRP2O60462 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRP2O60462 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms