Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXN3O00409 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN3O00409 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms