Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KRW8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KRW8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KRW8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms