Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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TRBV5-3A0A0A0MS03 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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TRBV5-3A0A0A0MS03 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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