Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN7Q9Y6W3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms