Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHBDD3Q9Y3P4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms