Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL1Q9UKG1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms