Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms