Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 826.3 ms