Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms