Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms