Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR10

SPATA25, Spermatogenesis-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA25Q9BR10 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPATA25Q9BR10 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms