Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PFDN5Q99471 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PFDN5Q99471 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PFDN5Q99471 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PFDN5Q99471 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PFDN5Q99471 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PFDN5Q99471 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PFDN5Q99471 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PFDN5Q99471 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PFDN5Q99471 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PFDN5Q99471 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PFDN5Q99471 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PFDN5Q99471 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PFDN5Q99471 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PFDN5Q99471 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PFDN5Q99471 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PFDN5Q99471 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms