Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C12orf42Q96LP6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf42Q96LP6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms