Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPNS2Q96L46 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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