Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXNL1Q96CM4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXNL1Q96CM4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms