Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C4orf3Q8WVX3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf3Q8WVX3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms