Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2L2Q86YR7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MCF2L2Q86YR7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCF2L2Q86YR7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCF2L2Q86YR7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCF2L2Q86YR7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCF2L2Q86YR7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCF2L2Q86YR7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCF2L2Q86YR7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCF2L2Q86YR7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCF2L2Q86YR7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCF2L2Q86YR7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms