Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC30Q5VVM6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms