Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WASHC2DQ5SRD0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.2 ms