Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217 ms