Protein–RNA interactions for Protein: Q15041

ARL6IP1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL6IP1Q15041 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL6IP1Q15041 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL6IP1Q15041 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL6IP1Q15041 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL6IP1Q15041 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL6IP1Q15041 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL6IP1Q15041 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms