Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HNF4GQ14541 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HNF4GQ14541 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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