Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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