Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFIAQ12857 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NFIAQ12857 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms