Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCEQ02156 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms