Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POU5F1Q01860 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms