Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms