Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2E1P29083 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2E1P29083 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2E1P29083 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GTF2E1P29083 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GTF2E1P29083 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2E1P29083 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GTF2E1P29083 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2E1P29083 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2E1P29083 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2E1P29083 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2E1P29083 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GTF2E1P29083 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2E1P29083 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GTF2E1P29083 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2E1P29083 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GTF2E1P29083 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2E1P29083 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2E1P29083 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2E1P29083 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2E1P29083 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2E1P29083 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2E1P29083 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2E1P29083 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GTF2E1P29083 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2E1P29083 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2E1P29083 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2E1P29083 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2E1P29083 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2E1P29083 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2E1P29083 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2E1P29083 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2E1P29083 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2E1P29083 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2E1P29083 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2E1P29083 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GTF2E1P29083 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GTF2E1P29083 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2E1P29083 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2E1P29083 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2E1P29083 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2E1P29083 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2E1P29083 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2E1P29083 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2E1P29083 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2E1P29083 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2E1P29083 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2E1P29083 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2E1P29083 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2E1P29083 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2E1P29083 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2E1P29083 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2E1P29083 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2E1P29083 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2E1P29083 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2E1P29083 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2E1P29083 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2E1P29083 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GTF2E1P29083 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2E1P29083 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2E1P29083 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2E1P29083 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms