Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CA4P22748 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA4P22748 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CA4P22748 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA4P22748 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CA4P22748 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA4P22748 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA4P22748 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA4P22748 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA4P22748 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA4P22748 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA4P22748 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA4P22748 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA4P22748 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA4P22748 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA4P22748 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA4P22748 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA4P22748 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA4P22748 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA4P22748 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA4P22748 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA4P22748 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA4P22748 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA4P22748 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA4P22748 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA4P22748 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CA4P22748 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA4P22748 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA4P22748 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA4P22748 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA4P22748 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA4P22748 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA4P22748 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA4P22748 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA4P22748 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA4P22748 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA4P22748 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA4P22748 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA4P22748 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA4P22748 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CA4P22748 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA4P22748 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA4P22748 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA4P22748 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA4P22748 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CA4P22748 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA4P22748 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA4P22748 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA4P22748 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA4P22748 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA4P22748 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA4P22748 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CA4P22748 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CA4P22748 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA4P22748 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA4P22748 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA4P22748 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA4P22748 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA4P22748 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA4P22748 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA4P22748 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA4P22748 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA4P22748 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA4P22748 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA4P22748 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA4P22748 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA4P22748 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA4P22748 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA4P22748 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA4P22748 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA4P22748 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA4P22748 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA4P22748 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA4P22748 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA4P22748 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA4P22748 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA4P22748 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA4P22748 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA4P22748 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA4P22748 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA4P22748 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA4P22748 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA4P22748 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA4P22748 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA4P22748 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA4P22748 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA4P22748 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CA4P22748 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA4P22748 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA4P22748 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA4P22748 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA4P22748 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA4P22748 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA4P22748 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA4P22748 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA4P22748 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA4P22748 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA4P22748 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA4P22748 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA4P22748 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.2 ms