Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTHFD1P11586 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms