Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DMDP11532 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DMDP11532 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DMDP11532 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DMDP11532 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DMDP11532 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DMDP11532 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DMDP11532 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DMDP11532 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DMDP11532 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DMDP11532 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DMDP11532 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DMDP11532 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DMDP11532 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DMDP11532 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DMDP11532 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DMDP11532 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DMDP11532 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DMDP11532 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DMDP11532 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DMDP11532 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DMDP11532 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DMDP11532 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DMDP11532 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DMDP11532 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DMDP11532 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DMDP11532 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DMDP11532 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DMDP11532 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DMDP11532 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DMDP11532 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DMDP11532 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DMDP11532 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DMDP11532 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DMDP11532 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DMDP11532 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DMDP11532 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DMDP11532 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DMDP11532 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DMDP11532 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DMDP11532 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DMDP11532 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DMDP11532 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DMDP11532 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DMDP11532 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMDP11532 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMDP11532 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMDP11532 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMDP11532 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DMDP11532 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DMDP11532 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMDP11532 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMDP11532 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMDP11532 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMDP11532 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMDP11532 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMDP11532 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DMDP11532 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMDP11532 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DMDP11532 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DMDP11532 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DMDP11532 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DMDP11532 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DMDP11532 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
DMDP11532 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DMDP11532 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
DMDP11532 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DMDP11532 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DMDP11532 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DMDP11532 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DMDP11532 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DMDP11532 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMDP11532 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMDP11532 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMDP11532 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMDP11532 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMDP11532 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMDP11532 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMDP11532 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMDP11532 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMDP11532 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMDP11532 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMDP11532 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMDP11532 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMDP11532 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMDP11532 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMDP11532 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMDP11532 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMDP11532 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMDP11532 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMDP11532 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMDP11532 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMDP11532 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMDP11532 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMDP11532 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DMDP11532 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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