Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRNPP04156 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRNPP04156 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRNPP04156 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRNPP04156 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRNPP04156 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRNPP04156 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRNPP04156 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRNPP04156 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRNPP04156 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRNPP04156 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRNPP04156 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRNPP04156 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRNPP04156 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRNPP04156 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRNPP04156 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRNPP04156 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRNPP04156 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRNPP04156 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRNPP04156 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRNPP04156 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRNPP04156 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRNPP04156 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRNPP04156 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRNPP04156 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRNPP04156 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRNPP04156 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRNPP04156 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRNPP04156 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRNPP04156 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRNPP04156 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRNPP04156 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRNPP04156 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRNPP04156 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRNPP04156 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRNPP04156 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRNPP04156 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRNPP04156 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRNPP04156 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRNPP04156 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRNPP04156 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRNPP04156 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRNPP04156 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRNPP04156 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRNPP04156 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRNPP04156 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRNPP04156 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRNPP04156 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRNPP04156 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRNPP04156 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRNPP04156 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRNPP04156 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRNPP04156 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRNPP04156 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRNPP04156 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRNPP04156 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRNPP04156 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRNPP04156 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRNPP04156 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRNPP04156 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRNPP04156 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRNPP04156 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRNPP04156 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRNPP04156 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRNPP04156 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRNPP04156 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRNPP04156 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRNPP04156 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRNPP04156 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRNPP04156 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRNPP04156 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRNPP04156 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRNPP04156 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRNPP04156 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRNPP04156 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRNPP04156 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRNPP04156 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRNPP04156 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRNPP04156 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRNPP04156 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRNPP04156 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRNPP04156 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRNPP04156 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRNPP04156 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms