Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE2O96020 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms