Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP19O94966 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP19O94966 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
USP19O94966 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
USP19O94966 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP19O94966 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP19O94966 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP19O94966 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP19O94966 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP19O94966 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP19O94966 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP19O94966 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
USP19O94966 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP19O94966 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP19O94966 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
USP19O94966 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP19O94966 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP19O94966 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP19O94966 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP19O94966 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
USP19O94966 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP19O94966 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP19O94966 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP19O94966 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP19O94966 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP19O94966 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP19O94966 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP19O94966 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP19O94966 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP19O94966 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP19O94966 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP19O94966 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP19O94966 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP19O94966 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP19O94966 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP19O94966 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP19O94966 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
USP19O94966 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP19O94966 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP19O94966 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP19O94966 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
USP19O94966 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP19O94966 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP19O94966 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP19O94966 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP19O94966 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
USP19O94966 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP19O94966 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP19O94966 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP19O94966 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP19O94966 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP19O94966 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP19O94966 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP19O94966 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP19O94966 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP19O94966 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP19O94966 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP19O94966 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP19O94966 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
USP19O94966 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
USP19O94966 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP19O94966 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP19O94966 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP19O94966 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP19O94966 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP19O94966 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP19O94966 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP19O94966 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP19O94966 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
USP19O94966 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP19O94966 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
USP19O94966 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP19O94966 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP19O94966 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP19O94966 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP19O94966 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP19O94966 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP19O94966 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP19O94966 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP19O94966 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP19O94966 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP19O94966 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
USP19O94966 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP19O94966 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP19O94966 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP19O94966 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP19O94966 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP19O94966 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP19O94966 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP19O94966 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP19O94966 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP19O94966 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP19O94966 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP19O94966 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP19O94966 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP19O94966 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP19O94966 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP19O94966 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
USP19O94966 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP19O94966 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms