Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSO75390 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSO75390 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSO75390 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSO75390 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSO75390 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSO75390 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CSO75390 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CSO75390 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CSO75390 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSO75390 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSO75390 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSO75390 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSO75390 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CSO75390 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSO75390 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSO75390 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSO75390 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSO75390 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSO75390 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSO75390 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSO75390 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSO75390 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSO75390 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSO75390 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CSO75390 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSO75390 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSO75390 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSO75390 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSO75390 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSO75390 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSO75390 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSO75390 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSO75390 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSO75390 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSO75390 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSO75390 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSO75390 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSO75390 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSO75390 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSO75390 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSO75390 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSO75390 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSO75390 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSO75390 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSO75390 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSO75390 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSO75390 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSO75390 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSO75390 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSO75390 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSO75390 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSO75390 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSO75390 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSO75390 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSO75390 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSO75390 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSO75390 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSO75390 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSO75390 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSO75390 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSO75390 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSO75390 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSO75390 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSO75390 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSO75390 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSO75390 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSO75390 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSO75390 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSO75390 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSO75390 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSO75390 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSO75390 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSO75390 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSO75390 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSO75390 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSO75390 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSO75390 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSO75390 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSO75390 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSO75390 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSO75390 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms