Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms