Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms