Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
EFCAB5A4FU69 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.18
EFCAB5A4FU69 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
EFCAB5A4FU69 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms