Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC6Q9Y210 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC6Q9Y210 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC6Q9Y210 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC6Q9Y210 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC6Q9Y210 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC6Q9Y210 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC6Q9Y210 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC6Q9Y210 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC6Q9Y210 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC6Q9Y210 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms