Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CGGBP1Q9UFW8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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